Kampüste inşa edilecek olan binalar Selçuklu mimarisine ait en özel örneklerden esinlenerek tasarlanmış. Yalova Üniversitesi’nin giriş kapısı ise Büyük Selçuklu Dönemi mimarisinin tüm gücüyle hissedildiği en önemli kervansarayların başında gelen Ribat-ı Şerif’ten esinlenerek dizayn edilecek. Üniversite kampüsü içerisinde yer alan diğer fakülteler de her biri eğitim verdiği branşla özdeş, Selçuklu mimarisi örneklerinden esinlenerek inşa edilecek.Üniversite kampüsü içerisinde yer alan Hukuk Fakültesi Sivas’ta bulunan Buruciye Medresesi örnek alınarak yapılacak. Buruciye Medresesi diğer adıyla, Hacı Mes’ud Medresesi 1271 yılında Anadolu Selçuklu sultanlarından 3.Gıyaseddin Keyhüsrev zamanında yapımış. İlmiye çalışmaları için medrese olarak yaptırılan eser, devrin pozitif bilimlerinin okutulduğu bina olarak uzun yıllar boyunca kullanılmış.Üniversite kampüsü içerisinde yer alan İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi ise Bünyan Kayseri’de bulunan Karatay Kervansarayı örnek alınarak inşa edilecek. Oldukça etkileyici ve abidevi bir görünüme sahip olan kervansaray, 1240 yılında ünlü Selçuklu Veziri Celaleddin Karatay tarafından yaptırılmış. Mühendislik Fakültesi ise Aksaray’da bulunan Sultanhan Kervansarayı örnek alınarak inşa edilecek.Kervansaray, 1.Alaaddin Keykubat tarafından yaptırılmış. İlahiyat Fakültesi ise Erzurum’da bulunan Çift Minareli Medrese’den esinlenerek yapılacak. Anadolu Selçuklularının en büyük sanat şaheserlerinden birisi olan ve Hatuniye Medresesi olarak da bilinen bu yapı, İlahiyat Fakültesi’nde yaşatılacak.